K přípravě podkladů a stanovisek pro jednání pléna a k podrobnému řešení jednotlivých problémů zřizuje Akademický senát Pedagogické fakulty pracovní komise, člen komise nemusí být nutně senátorem AS PedF UK. V současné době má senát legislativní, ekonomickou, studijní, a stipendijní komisi, komisi pro digitalizaci a technologie a komisi pro vědu, doktorská studia a internacionalizaci.
Pracovní komise jsou iniciační a kontrolní orgány senátu v jednotlivých oblastech jeho působnosti. Komise zřizuje AS PedF UK. Zřízení další komise může navrhnout člen senátu nebo děkan Pedagogické fakulty. Komise mohou být stálé nebo dočasné.
Členem komise může být každý člen senátu, který o to požádá, a další osoba, o které tak na základě její žádosti rozhodne senát.
Kandidát na člena komise se může přihlásit sám, nebo ho může navrhnout člen senátu, v takovém případě musí kandidát se členstvím v komisi souhlasit.
Členové nemusí být členy senátu s výjimkou předsedy komise.
Členství v komisi zaniká spolu se ztrátou mandátu člena senátu, pokud tento nebyl zvolen pro další volební období.
Členství akademického pracovníka v komisi zaniká též ukončením jeho pracovního poměru na fakultě.
Členství studenta v komisi zaniká též zánikem též členství v akademické obci fakulty.
Na schůzi komise senátu musí být pozváni všichni její členové.
Komise senátu může přijmout usnesení, jestliže jsou přítomni alespoň dva její členové z řad členů senátu. Usnesení je přijato většinou hlasů přítomných členů komise.
Jestliže se na tom komise senátu usnese nebo s vědomím předsedy nebo místopředsedy senátu ve věcech, které nesnesou odkladu, může komise zasedat v užším složení za účasti předsedy komise senátu nebo jím pověřeného člena komise senátu z řad členů senátu.
